目的：建立胡黄连SRAP的反应体系，并筛选出适合胡黄连的引物组合，为胡黄连的遗传多样性研究奠定基础。方法：采用5因素(dNTP、Mg2+、Taq酶、引物、DNA）4水平正交试验一步法建立SRAP-PCR 的反应体系，采用梯度温度法筛选PCR反应程序的最佳退火温度，对已发表的SRAP引物组合进行了筛选。结果：胡黄连SRAP-PCR的最佳反应体系，即20μL反应体系: 10×buffer 2μL,dNTP 150μmol·L-1, Mg2+ 3mmol·L-1,Taq酶2U，引物为05μmol·L-1，DNA为20ng, DMSO 1μL；最适的退火温度是300℃～332 ℃；最适的引物组合为Me1Em1, Me1Em2, Me1Em3, Me3Em3, Me1Em4, Me2Em4, Me3Em4, Me4Em4, Me1Em5, Me3Em5, Me4Em5, Me3Em6, Me4Em6。结论：该体系是适合胡黄连SRAP－PCR反应的最适宜体系，为今后胡黄连遗传多样性研究奠定了基础。